距離暗殺殺老師（二宮和也 配音）的暗殺最後期限越來越近，一直潛伏在三年E班的教室秘密武器也終於出動。背負莫大仇恨的畢業茅野楓（山本舞香 飾）露出瞭隱藏已久的觸角，向殺老師展開絕命襲擊。暗殺恰恰借助這一事件，教室殺老師講述瞭自己和E班曾經的畢業代課老師雪村亞久裡（桐谷美玲 飾）一段永生難忘的淵源。圍繞著暗殺行動是暗殺否進行，潮田渚（山田涼介 飾）、教室赤羽業（菅田將暉 飾）等人截然分成兩派。畢業他們一面希望令地球免於毀滅的暗殺 ，一面試圖拯救殺老師的教室生命。與此同時，畢業沉默已久的暗殺各國政府也開始醞釀最後的行動，而作為一切混亂的教室肇事者白先生（成宮寬貴 飾）亦將成為決定殺老師命運的重要存在。師生告別的畢業時刻終將到來……　　本片根據松井優征的超人氣漫畫改編。