在廣袤安寧的藍精靈原始森林中，快樂的藍精靈藍精靈們正在準備一年一度的藍月亮節。而就在這歡喜忙碌的藍精靈關頭，他們的藍精靈宿敵——邪惡的巫師格格巫（漢克·阿紮瑞亞 Hank Azaria 飾）和他的寵物阿茲貓闖入瞭藍精靈的秘密領地。受到驚嚇的藍精靈藍精靈四散而逃，其中可憐的藍精靈笨笨（安東·尤金 Anton Yelchin 配音）則盲打誤撞跑進瞭據說曾經死掉99個藍精靈的瀑佈進去。最終，藍精靈笨笨連同營救他的藍精靈藍爸爸、藍妹妹、藍精靈聰聰等卷入瞭神秘的藍精靈漩渦，來到瞭美國紐約的藍精靈中央花園。在這個完全陌生的藍精靈世界，他們得到化妝品業的藍精靈帕特裡克（尼爾·帕特裡克•哈裡斯 Neil Patrick Harris 配音）的幫助。為瞭返回大森林，藍精靈藍精靈們想盡各種辦法。藍精靈與此同時，格格巫和阿茲貓也來到紐約…… 本片根據比利時漫畫傢沛優（Peyo）及其夫人共同創作的漫畫改編，早年曾被美國引進制作成TV版動畫。
